产品简介

环状RNA（circular RNA）是5’端和3’端共价结构闭合环状的非编码RNA，是广泛存在于动植物中的一种特殊的lncRNA，具有很高的保守性和组织特异性，独特的环状结构使其不易被RNase降解，在胞内具有较强的稳定性。按其来源可分为内含子CircRNA和外显子CircRNA两类，主要通过（1）作用于转录组因子，（2）竞争性结合miRNA，（3）结合核糖体诱导开环再重新表达等三种方式实现其调控基因表达的功能。CircRNA一经发现就因其独特的存在形式引起科学家的广泛兴趣，随着近几年测序技术的发展，CircRNA检测技术亦日渐成熟。

研究内容

1) 测序质量值分布统计；

2) 测序碱基质量控制；

3) 测序数据产出统计；

4) 测序文库质量评估；

5) 与参考序列进行比对（比对效率统计；比对结果作图）；

6) CIRI识别环状RNA；

7) circRNA的鉴定；

8) circRNA的统计；

9) circRNA来源基因功能注释;

10) circRNA表达定量分析（定量及统计）；

11) 聚类分析；

12) 样品间circRNA相关性分析（含生物学重复样品）；

13) circRNA差异表达分析；

14) 差异表达circRNA数目统计及聚类分析；

15) 差异表达circRNA来源基因的功能注释（NR，GO，KEGG等）及富集分析；

16) 差异表达circRNA来源基因蛋白互作网络分析。

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